Одитна дирекция I "Финансови одити"
Отдел 1 " Централни органи и държавни висши училища";
Отдел 2 "Централни органи и държавни висши училища";
Отдел 3 - "Местни органи".
Одитни дирекции
Одитна дирекция II "Финансови одити"
Директор: Ю. Качкова
Отдел 1 " Централни органи";
Отдел 2 "Местни органи";
Отдел 3 - "Местни органи".
Одитна дирекция "Одити за съответствие при финансовото управление"
Отдел 1 " Централни органи";
Отдел 2 "Централни органи";
Отдел 3 - "Местни органи"
Отдел 4 - "Местни органи".
Одитна дирекция "Одити на изпълнението"
Директор: Росена Гаджева
Одитна дирекция "Специфични одити"
Директор: Е. Перчева
Отдел 1 "Политически партии";
Отдел 2 "Други специфични одити".